Les IRA sont dues à différents virus respiratoires dont le SARS-CoV-2 (Covid-19), les virus grippaux et d’autres virus respiratoires comme le VRS, le rhinovirus, ou le métapneumovirus. La surveillance des IRA a pour objectif le suivi des épidémies dues à ces virus.
 
En France hexagonale, la semaine dernière (2026s06), le taux d’incidence des cas d’infection respiratoire aiguë (IRA) vus en consultation de médecine générale a été estimé à 322 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [310 ; 333]).
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est en diminution par rapport à la semaine précédente et se situe à un niveau d’activité similaire à ceux observés habituellement en cette période (données consolidées pour 2026s05 : 356 [344 ; 367]).

Au niveau régional, les taux d’incidence les plus élevés ont été observés en : Bretagne (449 [393 ; 505]), Provence-Alpes-Côte d’Azur (391 [342 ; 440]) et Auvergne-Rhône-Alpes (362 [327 ; 396]). 

Grippe : le taux d’incidence des cas de grippe vus en consultation de médecine générale pour une IRA a été estimé à 80 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [63 ; 97]) (sources de données : Sentinelles, SOS Médecins, DMGs Côte d’Azur, Rouen et Strasbourg).
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est en nette diminution (données consolidées pour 2026s05 : 132 [115 ; 149]) et se situe à un faible niveau d'activité.

Infection à VRS : le taux d’incidence des cas d’infection à VRS vus en consultation de médecine générale pour une IRA a été estimé à 25 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [17 ; 33]) (sources de données : Sentinelles, SOS Médecins, DMGs Côte d’Azur, Rouen et Strasbourg).
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est stable (données consolidées pour 2026s05 : 27 [20 ; 34]) et se situe à un niveau d'activité modéré.

Bronchiolite chez les enfants de moins d’un an : le taux d’incidence des cas de bronchiolite chez les enfants de moins d’un an vus en consultation de médecine générale a été estimé à 295 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [126 ; 464]) (source de données : IQVIA (EMR)).
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est stable (données consolidées pour 2026s05 : 381 [192 ; 570]) et se situe à un faible niveau d'activité.

Covid-19 : le taux d’incidence des cas de Covid-19 vus en consultation de médecine générale pour une IRA a été estimé à 7 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [5 ; 10]) (source de données : Sentinelles).
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est stable (données consolidées pour 2026s05 : 10 [4 ; 15]) et se situe à un faible niveau d'activité.

La surveillance des diarrhées aiguës a pour objectif le suivi des épidémies de gastro-entérites.
 
En France hexagonale, la semaine dernière (2026s06), le taux d’incidence des cas de diarrhée aiguë vus en consultation de médecine générale a été estimé à 103 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [96 ; 109]). 
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est en légère augmentation depuis plusieurs semaines et se situe à un niveau d’activité similaire à ceux observés habituellement en cette période (données consolidées pour 2026s05 : 99 [93 ; 105]).

Au niveau régional, les taux d'incidence les plus élevés ont été observés en : Provence-Alpes-Côte d’Azur (204 [168 ; 239]), Bretagne (128 [97 ; 159]) et Hauts-de-France (125 [99 ; 150]).

Sources de données : Sentinelles et IQVIA (EMR)

En France hexagonale, la semaine dernière (2026s06), le taux d’incidence des cas de varicelle vus en consultation de médecine générale a été estimé à 11 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [9 ; 13]). 
Sous réserve de la consolidation à venir des données, ce taux est stable par rapport à la semaine précédente et se situe à un niveau d’activité inférieur à ceux observés habituellement en cette période (données consolidées pour 2026s05 : 11 [9 ; 13]).

Au niveau régional, les taux d'incidence les plus élevés ont été observés en : Nouvelle-Aquitaine (19 [9 ; 28]), Corse (17 [0 ; 42]) et Ile-de-France (15 [9 ; 20]).

Sources de données : Sentinelles et IQVIA (EMR)