Études ponctuelles

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Contexte

Bien que chez l’Homme, les virus influenza (VI) se répliquent principalement au niveau des voies supérieures et inférieures du système respiratoire [1], des troubles gastro-intestinaux (GI)  tels que les diarrhées aiguës, les douleurs abdominales, les nausées et les vomissements, sont parfois observés, particulièrement en début d’infection [2].

De nombreuses études ont décrit, pour les patients infectés par le virus Influenza A(H5N1), des charges virales très élevées au niveau des selles et démontré sa capacité à se multiplier au niveau des cellules intestinales [3]. Mais à ce jour, le rôle des virus Influenza saisonniers A (A(H1N1), A(H3N2) et A(H1N1)pdm2009) et B est peu connu au niveau du tube digestif et dans le développement des symptômes GI [2].

La présence de ces virus dans les selles des patients présentant un syndrome grippal (SG), décrite par quelques études, soulève la question d’une possible infection du tube digestif et, par conséquent, d’une possible transmission fécale-orale de ces virus.

Etudier les différentes étapes menant jusqu’à l’excrétion du virus Influenza au niveau des selles chez l’Homme pourrait apporter des éléments de réponse essentiels pour le contrôle et la gestion des épidémies de grippe et de gastro-entérite.

Objectifs
* Estimation de la prévalence des cas de grippes confirmées présentant du virus Influenza au niveau des selles, consultant en médecine générale, pédiatrie et aux urgences hospitalières.
* Détermination des facteurs de risques cliniques et sociodémographiques associés.
* Estimation de la survie des virus Influenza excrétés au niveau des selles et leur potentiel infectieux au niveau des cellules intestinales.
* Recherche de variants génétiques pouvant expliquer ce phénomène.

Méthodes

Etude de la prévalence sera réalisée grâce aux résultats des analyses virologiques des prélèvements nasopharyngés et de selles des patients, inclus dans l'étude, présentant  un SG de moins de 48 heures selon la définition de l’ECDC : Apparition soudaine des symptômes : fièvre ou frissons ou fatigue/épuisement ou mal de tête ou douleurs musculaires/articulaires ET toux ou mal de gorge ou essoufflement et consultant leur médecin généraliste, pédiatre ou les urgences hospitalières.

Une étude de type « test negative design » sera réalisée pour déterminer les facteurs de risque cliniques et sociodémographiques pouvant influer sur la présence des virus Influenza au niveau des selles.

Une approche in vitro sera mise en place en collaboration avec l’Unité EPVO (Institut Pasteur, Paris). Ce module permettra de tester la possible implication de la muqueuse intestinale humaine aux virus grippaux, à partir des échantillons de terrain collectés.

La mise en évidence de potentiels variants entre les virus Influenza détecté sera réalisée via le séquençage complet du génome des virus typés et sous typés. Cela permettra de mettre en évidence l’éventuel effet de certaines mutations sur les interactions virus-cellules étudiées.

Résultats

La collecte des données est actuellement en cours, nous vous tiendrons au courant des résultats dès que possible.

Si vous êtes médecins généralistes, ou pédiatres et que ce projet vous interesse, n'hésitez pas à nous contacter.

Un grand merci à tous les médecins Sentinelles qui participent à cette étude !