Études ponctuelles

Contexte

Le projet SISP&EaU est porté par l’Institut Pierre Louis d’Epidémiologie et de Santé publique, dont fait partie le réseau Sentinelles, et par le réseau Obépine (Observatoire épidémiologique dans les eaux usées). Ce projet est financé par le programme de recherche maladies infectieuses émergentes (PEPR MIE) de France 2030.

SISP&EaU est un projet pluridisciplinaire qui réunit des spécialistes de différents domaines (épidémiologie, mathématiques, microbiologie, génomique, hydrologie, et sciences sociales) issus de 13 unités de recherche, ainsi que de nombreux partenaires parmi lesquels le consortium P4DP, la société IQVIA, et Santé Publique France.

Dans un contexte post-pandémie Covid-19, l’objectif du projet est de définir quelles sources sont pertinentes pour la surveillance épidémique ; c’est-à-dire comment, quand et quoi mesurer pour détecter et surveiller les émergences ou réémergences de pathogènes, avec des systèmes acceptés par la population et intégrés au processus de décision des autorités sanitaires.

Le réseau Sentinelles est impliqué dans différents aspects du projet, détaillés dans les points ci-dessous.

1) Renforcement d’indicateurs locaux pour une surveillance épidémiologique complète

Objectif : Étudier les relations entre différents indicateurs épidémiologiques.

Méthode : Collecter pendant une année des données fines et robustes (à l’échelle départementale) issues de différentes sources sur la circulation des virus respiratoires.

Zone d’étude : Bas-Rhin et Alpes-Maritimes, deux départements aux caractéristiques comparables en termes de démographie, nombre de médecins généralistes, nombre de pharmacies.

Données collectées : données cliniques et/ou virologiques en médecine générale, population générale, pharmacies et eaux usées.

2) Utilisation de mouchoirs en papier usagés pour la surveillance virologique épidémiologique

Objectif : Mesurer la concordance des résultats de la recherche de 5 virus respiratoires (SARS-CoV-2 (Covid-19), virus grippaux, virus respiratoire syncytial (VRS), rhinovirus et métapneumovirus) en fonction du type de prélèvement : prélèvement naso-pharyngé ; recueil salivaire ; recueil de sécrétions de mucus nasal dans un mouchoir en papier.

Méthode : 500 patients vus en consultation de médecine générale pour une infection respiratoire aigüe (selon la définition du réseau Sentinelles) seront inclus, et prélevés par un test naso-pharyngé précédé d’un mouchage. Le mouchoir usagé sera recueilli pour être analysé en parallèle du test naso-pharyngé.

Déroulement de l'étude : Les prélèvements seront effectués durant la saison hivernale 2024-2025 par certains médecins généralistes et internes des départements de médecine générale (DMG) des Universités de Rouen et Côte d'Azur (Nice).